MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002679	GTCG	2	8	271172	271179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_002679	CG	4	8	271187	271194	0 %	0 %	50 %	50 %	13488296
5503	NC_002679	TCA	2	6	271220	271225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488296
5504	NC_002679	GACAGC	2	12	271253	271264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488296
5505	NC_002679	CG	3	6	271331	271336	0 %	0 %	50 %	50 %	13488296
5506	NC_002679	GT	3	6	271433	271438	0 %	50 %	50 %	0 %	13488296
5507	NC_002679	GCG	3	9	271462	271470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488296
5508	NC_002679	CGAG	2	8	271480	271487	25 %	0 %	50 %	25 %	13488296
5509	NC_002679	GCAG	2	8	271488	271495	25 %	0 %	50 %	25 %	13488296
5510	NC_002679	CGG	2	6	271566	271571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488296
5511	NC_002679	GCC	2	6	271614	271619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488296
5512	NC_002679	GGA	2	6	271668	271673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488296
5513	NC_002679	GAT	2	6	271674	271679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488296
5514	NC_002679	CTG	2	6	271715	271720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488297
5515	NC_002679	TGC	2	6	271734	271739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488297
5516	NC_002679	ATC	2	6	271778	271783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488297
5517	NC_002679	AGGC	2	8	271826	271833	25 %	0 %	50 %	25 %	13488297
5518	NC_002679	AC	3	6	271858	271863	50 %	0 %	0 %	50 %	13488297
5519	NC_002679	GGCC	2	8	271907	271914	0 %	0 %	50 %	50 %	13488297
5520	NC_002679	GAA	2	6	271990	271995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488297
5521	NC_002679	GCG	2	6	272073	272078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488297
5522	NC_002679	CGC	2	6	272094	272099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488297
5523	NC_002679	CTGT	2	8	272104	272111	0 %	50 %	25 %	25 %	13488297
5524	NC_002679	CGCTG	2	10	272117	272126	0 %	20 %	40 %	40 %	13488297
5525	NC_002679	CTGG	2	8	272129	272136	0 %	25 %	50 %	25 %	13488138
5526	NC_002679	GCAT	2	8	272148	272155	25 %	25 %	25 %	25 %	13488138
5527	NC_002679	GCC	2	6	272163	272168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488138
5528	NC_002679	GGC	2	6	272183	272188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488138
5529	NC_002679	AGA	2	6	272201	272206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488138
5530	NC_002679	TCA	2	6	272250	272255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488138
5531	NC_002679	CGC	2	6	272267	272272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488138
5532	NC_002679	ATC	2	6	272292	272297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488138
5533	NC_002679	TCC	2	6	272322	272327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488138
5534	NC_002679	TGC	2	6	272384	272389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488138
5535	NC_002679	GCA	2	6	272433	272438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488138
5536	NC_002679	TGAA	2	8	272443	272450	50 %	25 %	25 %	0 %	13488138
5537	NC_002679	ATA	2	6	272489	272494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488138
5538	NC_002679	CTC	2	6	272564	272569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488138
5539	NC_002679	GC	3	6	272614	272619	0 %	0 %	50 %	50 %	13488138
5540	NC_002679	AAG	2	6	272646	272651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488138
5541	NC_002679	CAT	2	6	272668	272673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488138
5542	NC_002679	ATC	2	6	272684	272689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488138
5543	NC_002679	TCG	2	6	272691	272696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488138
5544	NC_002679	CCG	2	6	272703	272708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488138
5545	NC_002679	AAC	2	6	272723	272728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488138
5546	NC_002679	GCG	2	6	272811	272816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488138
5547	NC_002679	GT	3	6	272842	272847	0 %	50 %	50 %	0 %	13488138
5548	NC_002679	GAG	2	6	272898	272903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488138
5549	NC_002679	CAA	2	6	272956	272961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488138
5550	NC_002679	GGCG	2	8	272974	272981	0 %	0 %	75 %	25 %	13488138
5551	NC_002679	CG	3	6	272990	272995	0 %	0 %	50 %	50 %	13488138
5552	NC_002679	GA	3	6	272999	273004	50 %	0 %	50 %	0 %	13488138
5553	NC_002679	AGG	2	6	273045	273050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488138
5554	NC_002679	TAG	2	6	273090	273095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488138
5555	NC_002679	CGC	2	6	273169	273174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488138
5556	NC_002679	GAA	2	6	273203	273208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488138
5557	NC_002679	CCT	2	6	273343	273348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488138
5558	NC_002679	CCA	2	6	273429	273434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488138
5559	NC_002679	GA	3	6	273469	273474	50 %	0 %	50 %	0 %	13488138
5560	NC_002679	GTG	2	6	273570	273575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488138
5561	NC_002679	CGA	2	6	273628	273633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488138
5562	NC_002679	AGA	2	6	273774	273779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_002679	GGA	2	6	273826	273831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_002679	CAT	2	6	273871	273876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_002679	GCC	2	6	274045	274050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488139
5566	NC_002679	GGC	2	6	274052	274057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488139
5567	NC_002679	CGA	2	6	274112	274117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488139
5568	NC_002679	GGC	2	6	274128	274133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488139
5569	NC_002679	GCC	2	6	274147	274152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488139
5570	NC_002679	CGG	2	6	274184	274189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488139
5571	NC_002679	GACCG	2	10	274227	274236	20 %	0 %	40 %	40 %	13488139
5572	NC_002679	TCG	2	6	274246	274251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488139
5573	NC_002679	CGA	2	6	274349	274354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488139
5574	NC_002679	GT	3	6	274403	274408	0 %	50 %	50 %	0 %	13488139
5575	NC_002679	TGG	2	6	274501	274506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488139
5576	NC_002679	GCA	2	6	274515	274520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488139
5577	NC_002679	GTG	2	6	274540	274545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488139
5578	NC_002679	GAC	2	6	274560	274565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488139
5579	NC_002679	CTTGGT	2	12	274572	274583	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	13488139
5580	NC_002679	CTTTC	2	10	274609	274618	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5581	NC_002679	GCGA	2	8	274722	274729	25 %	0 %	50 %	25 %	13488340
5582	NC_002679	TTC	2	6	274757	274762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488340
5583	NC_002679	GCG	2	6	274822	274827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488340
5584	NC_002679	GCA	2	6	274867	274872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488340
5585	NC_002679	CCG	2	6	274875	274880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488340
5586	NC_002679	TGCCA	2	10	274949	274958	20 %	20 %	20 %	40 %	13488340
5587	NC_002679	GCT	3	9	275006	275014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488340
5588	NC_002679	CCG	2	6	275039	275044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488340
5589	NC_002679	CGAGG	2	10	275105	275114	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5590	NC_002679	ACG	2	6	275134	275139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488362
5591	NC_002679	GCC	2	6	275232	275237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488362
5592	NC_002679	CGT	2	6	275264	275269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488362
5593	NC_002679	TCAAGG	2	12	275284	275295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13488362
5594	NC_002679	GCAGG	2	10	275315	275324	20 %	0 %	60 %	20 %	13488362
5595	NC_002679	GAA	2	6	275357	275362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_002679	ATG	2	6	275376	275381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_002679	GC	3	6	275446	275451	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
5598	NC_002679	GCA	2	6	275477	275482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488140
5599	NC_002679	GCA	2	6	275491	275496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488140
5600	NC_002679	GA	3	6	275518	275523	50 %	0 %	50 %	0 %	13488140
5601	NC_002679	TGC	2	6	275536	275541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488140
5602	NC_002679	TGC	2	6	275556	275561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488140
5603	NC_002679	GC	3	6	275741	275746	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
5604	NC_002679	TCCC	2	8	275772	275779	0 %	25 %	0 %	75 %	13488141
5605	NC_002679	TCC	2	6	275892	275897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488141
5606	NC_002679	GCC	2	6	275915	275920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
5607	NC_002679	GCC	2	6	276159	276164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
5608	NC_002679	CCG	2	6	276232	276237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
5609	NC_002679	CCA	2	6	276249	276254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488141
5610	NC_002679	TGAG	2	8	276266	276273	25 %	25 %	50 %	0 %	13488141
5611	NC_002679	ACG	2	6	276276	276281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
5612	NC_002679	ACG	2	6	276347	276352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
5613	NC_002679	GC	3	6	276363	276368	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
5614	NC_002679	TGC	2	6	276369	276374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
5615	NC_002679	TGG	2	6	276375	276380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488141
5616	NC_002679	GC	3	6	276400	276405	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
5617	NC_002679	CGC	2	6	276410	276415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
5618	NC_002679	TCG	2	6	276417	276422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
5619	NC_002679	CGC	2	6	276451	276456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
5620	NC_002679	CGG	2	6	276477	276482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488141
5621	NC_002679	CG	3	6	276517	276522	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
5622	NC_002679	CAA	2	6	276550	276555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488141
5623	NC_002679	CGA	2	6	276619	276624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
5624	NC_002679	TGC	2	6	276652	276657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
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5626	NC_002679	TGC	2	6	276704	276709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488142
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5640	NC_002679	CGG	3	9	277176	277184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5642	NC_002679	GC	4	8	277207	277214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5643	NC_002679	CGG	2	6	277222	277227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
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5664	NC_002679	AC	3	6	278122	278127	50 %	0 %	0 %	50 %	13488143
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5770	NC_002679	CG	3	6	283282	283287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5771	NC_002679	CTG	2	6	283309	283314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6000	NC_002679	ACG	2	6	294689	294694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488153

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